La E. histolytica existe en forma de quiste y de trofozoíto. Cuando se ingieren los quistes a través de frutas, verduras o agua contaminada, se adquiere la infección. Es una enfermedad de transmisión sexual en caso de parejas que realizan sexo anal o sexo anal-oral.
En general, las amebas se unen y matan las células epiteliales del colon causando disentería (diarrea con sangre). También se pueden movilizar a través de la sangre y llegar hasta el hígado, en donde originan abscesos necróticos, y a otros órganos como pulmones, corazón y cerebro.
Se presenta principalmente en personas que viven o que han viajado a países en vía de desarrollo, inmigrantes, hombres homosexuales, personas con escasa higiene y en contacto con agua y alimentos contaminados.